当建筑物内空气被流行性致病菌感染，而空调又得不到及时有效的消毒时，病菌就会通过中央空调“散布”，经呼吸道传播的疾病就更易被传播开来。非典期间禁止公共场所使用中央空调就是这个道理。空调传播疾病是一个隐性的过程，往往使人无法察觉，加之人们不能用肉眼直观判断空调风的洁净程度，所以极易被忽视。
中央空调系统中恒温、恒湿的环境为微生物的繁殖提供了良好的培养基，根据中央空调系统工作原理，空气在流通过程中都要经过风管，而一旦风管或风口受到污染，病毒、细菌等微生物就可以通过管道在整个空间内循环。当空调系统内细菌达到一定数量时，细菌将侵袭抵抗力弱的人，使其患上呼吸道系统疾病。
相对于一个地区、流域、森林这样的宏观生态环境，人类工作、生活和活动的人居环境是一种微观环境，据统计，人的一生有80%的时间是生活在室内这样一个微观环境中的，而且宏观环境的变化也是通过室内环境这样一个渠道来体现在人类身上，可见室内环境对人的重要性。可以说室内环境的污染是目前影响人类生活品质最重要的因素。而在现代都市环境中，室内环境条件恶劣，室内装潢引发的化学污染，集中式中央空调环境下封闭式的办公空间导致的生物污染，都是影响室内空气质量的重要因素。
